文革期间，红卫兵在北京贴金日成的大字报，扬言要逮捕“走资派”金日成。消息传到朝鲜，金日成闻讯大怒，当即下令捣毁志愿军烈士陵园，将烈士碑统统打烂，包括毛岸英的墓碑也被砸得粉碎。朝鲜战争之后，朝鲜战争之后，朝鲜就在我国东北展开了地下活动，为居住在我国东北与朝鲜毗邻的地区的朝鲜族同胞建立“祖国观念、领袖意识”，宣扬他们的“祖国”是朝鲜民主主义人民共和国。
坐落于中朝边界的长白山天池和白头峰，历来是我国的神圣领土。历史上中朝国界线在分水岭东下二十公里处，自南而北划定。朝方派员来华，提出分天池一角的要求，说什么“天池是伟大的金将军革命事业的发源地”，希望我国能理解朝鲜劳动人民深厚的无产阶级感情，等等。中方从各方面情况考虑就“切了”天池一半过去。朝方接收后的第二天，白头峰便更了名，改成了“将军峰”。
后来，朝方得寸进尺，指示其驻华使馆向中方提出照会，“严正声明”说：黑龙江省一部分、吉林省大部分、辽宁省一部分历史上都是属于高丽帝国的版图，后为中国历代王朝所侵占，而今中国已是社会主义国家，理应归还这些领土。经我国学者研究，认为这些是与高丽无关的中国领土，中方断然拒绝了他们的无理要求。
1965年2月，苏联部长会议主席柯西金访朝，双方重申与强调“苏朝友好互助条约”和苏朝友谊的重要性。随后不久，朝鲜派代表团出席苏共二十三大。5月，苏联同朝鲜签署了一项军事援助协定，莫斯科恢复对朝鲜的军事援助。1966年2月，朝苏签订《1966至1970年经济与技术合作协定》。1967年，苏联又同朝鲜签署了有关提供军事和经济、技术援助的协定。
从1965年开始，中朝两国在边界问题上多次发生争端，中国方面一度在1968年关闭中朝边界的中方通道。1965-1969年，两国没有签订新的文化与经济合作协定，也没有高层领导人的互访，朝方甚至召回了其驻华大使。1968年苏联入侵捷克斯洛伐克，朝鲜支持苏联的行动，与中国的态度截然相反。
期间，红卫兵在北京贴金日成的大字报，扬言要逮捕“走资派”金日成。消息传到朝鲜，金日成闻讯大怒，当即下令捣毁志愿军烈士陵园，将烈士碑统统打烂，包括毛岸英的墓碑也被砸得粉碎。与此同时，朝方在边境挂起高音大喇叭，大骂无耻言论，大喊：“金日成主席是我们心中的红太阳！”更有甚者，在鸭绿江上展开“驱水战”，朝鲜士兵在江心筑起大坝，将水驱往西岸，给中国造成水灾。
20世纪70年代初，大国关系、国际战略格局均发生了重大变化，中美苏战略大三角形成。美苏关系进入“缓和”时期，中美关系实现重大突破并走向正常化，而中苏关系则因为珍宝岛事件进一步恶化。同时，苏联出于同美国搞缓和的需要，不希望看到朝美关系过于紧张。
1969年4月15日朝鲜击落一架美国间谍飞机，苏联对这一事件并没有给予有力的支持，反而帮助美国一道寻找美机上可能的生还者。朝鲜对苏联的态度因此发生变化。同时中国纠正了“文革”期间对外关系中的极左路线。中朝高层互访再度活跃起来。
1969年新中国国庆20周年，金日成派朝鲜最高人民会议常任委员会委员长崔庸健来北京，祝贺中国国庆。根据毛主席的指示，周恩来于1970年4月对朝鲜进行了回访。金日成亲自到机场迎接，看到周恩来第一句话就动情地说：“总理累瘦了。”那次访问期间，周恩来与金日成举行了长时间的会谈，介绍了中国的情况，消除了不少误解，使中朝关系回到正常轨道。
1970年10月初，也就是周恩来访问平壤6个月后，金日成秘密前往北京，会见毛主席和周恩来。那也是他时隔几年之后对中国的一次访问。周恩来在百忙中亲自到西郊机场迎接，并陪同金日成至钓鱼台国宾馆18号楼。毛主席当晚前往驻地会见金日成，并设晚宴招待。
之后，周恩来接连两天与金日成举行会谈，就双边关系和国际问题深入交换意见。那次访问恰逢10月10日朝鲜劳动党成立25周年，周恩来十分细心周到，于当晚在人民大会堂举行宴会，招待金日成一行。金日成十分感动，讲话时一再表示感谢。
从这次之后，金日成又恢复了每年对中国的访问，有时一年来两次，每次来时，毛泽东主席都会见他，周恩来则与他长谈，就广泛的问题交换意见。据说金日成曾当面向毛泽东道歉，承认做错，并答应重建志愿军烈士陵园。毛泽东也对金日成说，友谊是主要的，误会是次要的。