上海医药工业有限公司前身为上海医药工业公司，始建于1956年8月；他作为政府对上海化学药品制造业实行统一领导的职能部门，并将药品生产纳入计划经济的轨道。通过“调整、巩固、充实、提高”的方针，上海化学药品制造业达到了发展。1964年11月改为中国医药工业公司上海分公司；公司试行“托拉斯”管理体制，上海化学药品制造业进一步得到发展；1968年10月托拉斯管理体制试行终止，恢复为上海医药工业公司；1987年9月行政性的上海医药工业公司撤消，改建为企业性的上海医药工业（集团）联合公司，隶属上海医药管理局管理；1992年7月为发挥集团的功能，经市医药局同意，组建上海医药工业（集团）公司。1997年11月按照《公司法》的规定和现代企业制度的要求，转制为上海医药工业有限公司。
    上海医药工业有限公司成立以来一贯奉行以规范办企业、以诚信昭市场、以品牌施战略、以质量求主导的公司经营准则，通过几年的不懈努力，使企业的发展迈上了一个崭新的台阶，已经成为工商联动的药品专业生产、经营的公司。